Juan Ruiz Naupari es el fundador y director internacional de Pneuma Institute. La sede internacional de Pneuma Institute se encuentra en Mount Shasta, California, EE. UU. Y cuenta con varias delegaciones en las tres Américas, Europa e India.

Juan es el creador de Psicología Transpersonal & Pneuma Breathwork, una perspectiva nueva y completa de la psicología transpersonal. Se basa en el estudio comparativo de la sabiduría de las antiguas tradiciones espirituales y filosóficas del planeta, así como en la expansión de la conciencia a través de la práctica de la Respiración Pneuma.

Su investigación se aplica en el campo de la psicoterapia, con un enfoque en la progresión psicológica y espiritual del ser humano. Juan Ruiz participa en congresos, imparte charlas y apoya el proceso interior de sus alumnos a nivel internacional. Actualmente ofrece formación tanto online como presencial en diferentes países. Esta formación está avalada por la Asociación Europea de Psicología Transpersonal (ETPA), por la Universidad Monástica Tibetana Gaden Shartse en India y por la Asociación Rumana de Psicólogos.
El Instituto Pneuma tiene acuerdos de colaboración con la Universidad Spiru Haret en Rumania y con la Universidad Monástica Gaden Shartshe en India. Es miembro de la European Transpersonal Association (EUROTAS) y de la International Breathwork Foundation (IBF).

En 2004, Juan organizó la visita de SS el XIV Dalai Lama a Puerto Rico y patrocinó la Iniciación Buda Maitreya dada por SS por primera vez en India en 2011. Desde 1992 ha desarrollado dos proyectos solidarios: El Proyecto Buda Maitreya, un programa enfocado en la reconstrucción del monasterio Gaden Shartse y la educación de sus monjes y el Proyecto Inkarri, creado para la conservación de los valores de la Gran Nación Q’ero del Perú.
Coordinó, junto con el Monasterio Gaden Shartse, la conmemoración del sexto centenario de la ascensión al Nirvana del Gran Lama Tsongkhapa, creador del linaje Gelugpa. Celebrado en la India en diciembre de 2019 con el apoyo de Su Santidad el Dalái Lama.